输卵管囊肿通常不会直接影响排尿功能。输卵管位于盆腔内，与膀胱和尿道有一定距离，单纯输卵管囊肿一般不会压迫尿道或膀胱，因此不会导致尿频、尿急或排尿困难等症状。

但当囊肿体积较大，例如直径超过一定范围时，可能压迫邻近的膀胱，影响尿液正常排出，从而出现排尿异常。此外，若囊肿合并感染引发盆腔广泛炎症，可能导致盆腔充血或水肿，间接对泌尿系统产生压迫，出现排尿不适。若排尿过程中出现明显异常，建议及时就医检查，通过超声明确囊肿位置、大小及其与周围器官的关系，排除其他泌尿系统疾病的可能，避免延误治疗。